Przedsiębiorstwo posiada zawsze możliwość wyboru czy chce zlecić oprogramowanie na zamówienie, dopasowane do indywidualnych potrzeb, czy zakupić program już istniejący na rynku. Zwykle jest tak, że programy komercyjne są tańsze, gdyż to samo kupuje większa liczba użytkowników. Niestety, ponieważ są pisane „dla ogółu”, nie są w stanie spełnić indywidualnych wymagań a możliwość osiągnięcia dzięki nim zwiększonych zysków czy też zmniejszonych kosztów poprzez zwiększenie operatywności są ograniczone.
Poniżej przedstawione zostały główne zalety zarówno jednych jak i drugich aplikacji:
| Oprogramowanie na zamówienie | Aplikacja komercyjna |
| Wymagania zleceniodawcy spełnione w 100% | Zwykle tańsza |
| Możliwość nieograniczonego modyfikowania / dopisywania nowych funkcji do aplikacji na zamówienie | Zwykle lepiej przetestowana, gdyż wcześniej używali jej inni użytkownicy |
| Brak konieczności wykupywania osobnych licencji na każdy komputer | Do kupienia od zaraz |
| Możliwość zaimplementowania funkcji nie posiadanych przez dostępne na rynku programy a więc stworzenie przewagi konkurencyjnej | |
| Łatwiejsza obsługa programu, gdyż posiada on tylko niezbędne funkcje | |
| Możliwość uzyskania szybkiej pomocy technicznej |
Mimo, że na świecie dostępnych jest coraz więcej aplikacji komercyjnych, znacznie bardziej wzrasta zainteresowanie oprogramowaniem na zamówienie. Dzieje się tak głównie dlatego, że obecnie dla uzyskania przewagi konkurencyjnej bezsensowne wydaje się wdrażanie tego, co konkurencja już ma. Firmy coraz bardziej nastawiają się na optymalizację swoich procesów, wykonywanie czynności szybciej, automatyzację. Ponadto z biegiem lat zwiększają się różnice w sposobie działalności firm będących nawet bliskimi konkurentami, co sprawia, że nie mogą używać tego samego oprogramowania ze względu na indywidualną specyfikę.
Ważny jest też fakt, że oprogramowanie na zamówienie jest coraz tańsze ze względu na rosnącą konkurencję na rynku i zamówienie takiego programu, biorąc pod uwagę czas jego późniejszego użycia i funkcjonalność, nie stanowi zbyt dużego wydatku.